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Problème

Exécuter un script ou des résultats de la commande R de l’erreur :

Erreur irrécupérable : Impossible de créer 'R_TempDir'

Erreur : 18:25 : symbole inattendu
17 : r < - c (REVO = Revobase::getRevoRepos()
18 : LOCAL_3.1

Exécution interrompue

Erreur : 18:25 : symbole inattendu
17 : r < - c (REVO = Revobase::getRevoRepos()
18 : LOCAL_3.1

Exécution interrompue

Solution

C’est généralement Impossible d’écrire dans le répertoire temporaire spécifié en cours pour la session de R, soit en raison d’autorisations ou d’épuisement de l’espace.

Par défaut, la session R sous Linux écrit ses fichiers temporaires pour chaque session dans un répertoire du formulaire '/ tmp/RtmpO2MIQ7' où le sous-répertoire sous le répertoire /tmp est généré de manière aléatoire pour chaque nouvelle session. Dans la session, vous pouvez déterminer le répertoire temporaire en cours avec la commande 'tempdir()'. Au début de la session, R vérifiera en premier lieu, à son tour, pour voir si les variables d’environnement TMPDIR, TMP et TEMP sont définies et utilisent le premier qui est défini comme le répertoire temp. Si aucune n’est définie, il utilisera par défaut /tmp. Si le répertoire /tmp est insuffisant pour contenir les fichiers de travail temporaires créés par certaines opérations de RevoScaleR, vous pouvez créer un système de remplacement de fichier temporaire avec plus d’espace que/tmp et exporter TMPDIR pointer vers elle dans l’environnement.

Pour les environnements de cluster, cela doit être effectuée sur tous les nœuds. Pour les clusters LSF, consultez la section 7.8.1 du Guide d’Installation RRE pour Linux LSF peut remplacer cette valeur TMPDIR dans certains cas et rediriger les fichiers tmp à /tmp quand même. Cela peut être désactivé dans le lsf.conf.

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