Si DeployR está instalado en un entorno de Linux mediante el usuario raíz, el Tomcat, MongoDB, procesos de Rserve, así como las sesiones de R invocadas para ejecutar secuencias de comandos se todos ejecutarán como usuario 'Apache'. Acceso a secuencias de comandos y conjuntos de datos, así como los controles de acceso de SELinux deben tener esto en cuenta.
Si DeployR se instaló mediante un usuario no raíz, todos los procesos de DeployR y sesiones de R se ejecutarán como ese usuario.
Se recomienda una instalación no-root de DeployR en Linux.