Debe pasar la salida de rxDTree() a rxPredict() (utilizando el 'tipo' = 'prob') para obtener las probabilidades de clase para cada observación en el conjunto de datos.
Este es un ejemplo rápido mediante el dataset 'iris':
# classification iris.sub <- c(sample(1:50, 25), sample(51:100, 25), sample(101:150, 25))
iris.dtree <- rxDTree(Species ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width,
data = iris[iris.sub, ], cp = 0.01)
iris.dtree
rxPredict(iris.dtree, iris[-iris.sub, ], type = "prob")