Se DeployR è installato in un ambiente Linux utilizzando l'utente principale, Tomcat, MongoDB, Rserve processi, nonché le sessioni R richiamate per eseguire gli script tutte verranno eseguite come utente "Apache". Accesso a script e DataSet, nonché gli eventuali controlli di accesso SELinux devono tenerne conto.
Se DeployR viene installato utilizzando un utente non di primo livello, tutti i processi di DeployR e sessioni R verranno eseguito come utente.
Si consiglia un'installazione non di primo livello di DeployR su Linux.