In un cluster, MapR 4.0.1 processi mapreduce R rivoluzione potrebbero non riuscire con l'errore:
2015-02-13 08:00:37, 657 FATAL [IPC Server gestore 2 52243] org.apache.hadoop.mapred.TaskAttemptListenerImpl: attività: attempt_1423734868663_0289_m_000000_0 - chiuso: java.io.IOException: VM R chiuso con codice di uscita: 1, uscita:script di avvio[1] VERO$fileName [1] NA$start [1] 0$length [1] 0/usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libExaCore.so.2(_Z21CriticalSignalHandleri+0x1e)[0x7fe02d3d423e] /usr/lib/jvm/java-1.7.0-openjdk-1.7.0.71.x86_64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so(+0x7e2628)[0x7fe0282f8628] /usr/lib/jvm/java-1.7.0-openjdk-1.7.0.71.x86_64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so(JVM_handle_linux_signal+0x95)[0x7fe0282fea55] /lib64/libpthread.so.0[0x30cec0f710] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libExaCore.so.2(_ZNK10CxAnalysis19HaveWriteDataSourceEv+0x0)[0x7fe02acbc280] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libExaCore.so.2(_ZN10CxAnalysis18GetWriteDataSourceEv+0x9)[0x7fe02acbcb49] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libRxLink.so.2(_Z19RxComputeHadoopTaskR11RListObjectR11RxAllocator+0x3b3)[0x7fe02e2a5d23] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libRxLink.so.2(_Z10RxUtilBaseP7SEXPREC+0x6db)[0x7fe02e2b2fab] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/library/RevoScaleR/rxLibs/x64/libRxLink.so.2(RxUtil+0x34)[0x7fe02e2b3f14] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/lib/libR.so(+0x9f36b)[0x7fe04083536b] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/lib/libR.so(Rf_eval+0x871)[0x7fe04086be91] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/lib/libR.so(Rf_ReplIteration+0x212)[0x7fe0408946a2] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/lib/libR.so(+0xfea59)[0x7fe040894a59] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/lib/libR.so(run_Rmainloop+0x44)[0x7fe040894f64] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/bin/exec/R(main+0x1b)[0x40084b] /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xfd)[0x30ce41ed5d] /usr/lib64/Revo-7.3/R-3.1.1/lib64/R/bin/exec/R[0x400739] Errore di segmentazione.in com.revolutionanalytics.scaleR.hadoop.Rscript.waitFor(Rscript.java:103)in com.revolutionanalytics.scaleR.hadoop.Rscript.run(Rscript.java:59)in com.revolutionanalytics.scaleR.hadoop.RDelegatingMapper.run(RDelegatingMapper.java:73)in org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runNewMapper (MapTask.java:773)in org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run (MapTask.java:345)in org.apache.hadoop.mapred.YarnChild$2.run (YarnChild.java:167)in java.security.AccessController.doPrivileged (metodo nativo)in javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:415)in org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1469)in org.apache.hadoop.mapred.YarnChild.main (YarnChild.java:162)
Su piattaforme MapR 4.0.1, la causa è la configurazione dell'ambiente di rivoluzione R Enterprise utilizzando la libreria libhdfs.so errato.Per aggirare il problema, verificare che le seguenti operazioni di configurazione post-installazione sono state adottate le rivoluzione R 7.3 nei cluster MapR 4.0.1:Nel nodo "client", creare la directory condivisa del file System nativo per ogni utente:1. sudo mkdir -p /var/RevoShare/mapr3. chmod 777 /var/RevoShare/mapr4. aggiungere. /usr/lib64/Revo-7.3/Scripts/RevoHadoopEnvVars.Site a /home/mapr/.bash_profileIn ogni nodo di lavoro, apportare le seguenti modifiche:
# cp scaleR-hadoop-0.1-SNAPSHOT.jar /opt/mapr/hadoop/hadoop-2.4.1/share/hadoop/common/lib/ # ln -s /opt/mapr/hadoop/hadoop-0.20.2/c++/Linux-amd64-64/lib/libhdfs.so /usr/lib64 # mv /opt/mapr/hadoop/hadoop-2.4.1/lib/native/libhdfs.so /opt/mapr/hadoop/hadoop-2.4.1/lib/native/libhdfs.so.save
L'installazione di rivoluzione R crea automaticamente un collegamento a ridimensionamento-hadoop-0.1-SNAPSHOT.jar $HADOOP_HOME/lib. Tuttavia, questa è la directory non corretta (è stato segnalato un bug) e il file deve essere collegato o copiato in /opt/mapr/hadoop/hadoop-2.4.1/share/hadoop/common/lib/.Collegamento /opt/mapr/hadoop/hadoop-0.20.2/c++/Linux-amd64-64/lib/libhdfs.so in /usr/lib64 avrà la certezza che è possibile trovare il libhdfs.so corretto da r di rivoluzione. Il terzo passaggio è necessario per spostare in modo libhdfs.so il problema.
