Você verá essa mensagem de erro no aplicativo Sincronização do OneDrive se um atalho não puder ser sincronizado:
Não é possível sincronizar o atalho
A pasta <nome da pasta> não pode ser sincronizada em <nome da pasta> porque ela já está sincronizando como um atalho.
Esse problema ocorre quando você tem atalhos para duas pastas separadas e, em seguida, uma pasta é movida para a outra. Você ainda pode acessar as duas pastas em seu computador e os arquivos continuarão a sincronizar conforme o esperado, mas você não verá uma pasta dentro da outra como elas são mostradas no OneDrive na Web.
Para contornar esse problema, remova o atalho para a subpasta (a pasta que foi movida para a pasta pai). Depois que o atalho for removido, o OneDrive sincronizará a nova estrutura de pasta/subpasta.
Clique com o botão direito do mouse na subpasta Explorador de Arquivos e selecione Remover atalho. Não se preocupe, isso removerá apenas o atalho, não a pasta ou o conteúdo.