Verá esta mensagem de erro na aplicação Sincronização do OneDrive se um atalho não puder ser sincronizado:
Não é possível sincronar o atalho
A pasta <nome da pasta> não pode ser sincronizado com um nome de pasta> porque já está a sincronização como um <atalho.
Este problema ocorre quando tem atalhos para duas pastas separadas e, em seguida, uma pasta é movida para a outra. Ainda pode aceder a ambas as pastas no seu PC e os ficheiros continuarão a ser sincronizados conforme esperado, mas não verá uma pasta dentro da outra, como é mostrado no OneDrive na Web.
Para resolver este problema, remova o atalho para a subpaixa (a pasta que foi movida para a pasta principal). Assim que o atalho for removido, o OneDrive sincroniza a nova pasta/subpase.
Clique com o botão direito do rato na subpase na Explorador de Ficheiros e selecione Remover atalho. Não se preocupe, isto apenas removerá o atalho e não a pasta ou os conteúdos.