Problema
Executando um script ou os resultados do comando R no erro:
Erro fatal: não é possível criar 'R_TempDir'
Erro: 18:25: símbolo inesperado
17: r < - c (REVO = Revobase::getRevoRepos()
18: LOCAL_3.1
^
Execução foi interrompida
Erro: 18:25: símbolo inesperado
17: r < - c (REVO = Revobase::getRevoRepos()
18: LOCAL_3.1
^
Execução foi interrompida
Solução
Isso é normalmente devido a uma incapacidade de gravação para o diretório temporário especificado atual da sessão R devido a permissões ou esgotamento de espaço.
Por padrão, a sessão R no Linux irá escrever seus arquivos temporários para cada sessão em um diretório do formulário ' tmp/RtmpO2MIQ7' onde o subdiretório em /tmp é gerado aleatoriamente para cada nova sessão. Dentro da sessão, é possível determinar o diretório temporário atual com o comando 'tempdir()'. No início da sessão, R verificarão primeiro, por sua vez, para verificar se as variáveis de ambiente TEMP, TMP e TMPDIR são definidas e usam aquela primeira que é definida como o diretório temporário. Se nenhum estiver definido, o padrão será /tmp. Se /tmp é inadequado para manter os arquivos de trabalho temporários criados por algumas operações de RevoScaleR, você pode criar um sistema de arquivo temp alternativo com mais espaço do que /tmp e exportar TMPDIR para apontar para ele no ambiente.
Para ambientes de cluster, isso deve ser feito em todos os nós. Para clusters LSF, consulte a seção 7.8.1 do RRE Installation Guide para Linux como LSF pode sobrescrever esse valor TMPDIR em alguns casos e redirecionar os arquivos tmp para /tmp assim mesmo. Isso pode ser desabilitado no lsf.conf.
