Poznámkové bloky by ste mali vždy zálohovať, rovnako ako ostatné súbory a údaje v počítači. Zlyhanie pevného disku a ľudská chyba sa môžu stať každému, a ak sa to stane vám, vaše poznámky budú nenávratne preč. Ak pravidelne zálohujete svoje poznámkové bloky, môžete ich kedykoľvek obnoviť.
OneNote dokáže uchovať manuálne a dokonca automatické zálohovanie všetkej vašej práce, čo však momentálne nie je možné vo OneNote pre web. Podrobný postup v počítačovej aplikácii OneNote 2016 nájdete v téme Zálohovanie poznámok a Obnovenie poznámok zo zálohy.