Verá esta mensagem de erro na aplicação Sincronização do OneDrive se não for possível sincronizar um atalho:
Não é possível sincronizar o atalho
O nome da pasta <não pode ser sincronizado em <nome> da pasta porque já está a sincronizar como um atalho.>
Este problema ocorre quando tem atalhos para duas pastas separadas e, em seguida, uma pasta é movida para a outra. Pode continuar a aceder a ambas as pastas no seu PC e os ficheiros continuarão a ser sincronizados conforme esperado, mas não verá uma pasta dentro da outra, como acontece no OneDrive na Web.
Para contornar esse problema, remova o atalho para a subpasta (a pasta que foi movida para a pasta pai ). Assim que o atalho for removido, o OneDrive sincronizará a nova estrutura de pastas/subpastas.
Clique com o botão direito do rato na subpasta no Explorador de Ficheiros e selecione Remover atalho. Não se preocupe, esta ação só remove o atalho e não a pasta ou o conteúdo.